El programa centra su investigación en las sub lineas propias del programa que son la producción animal alternativa y, la extensión y el desarrollo rural, el programa está adscrito a dos grupos de investigación registrados y categorizados en B en el Gruplac de Minciencias. Estos grpos son:
- Gestión Ambiental y de los recursos naturales
- Gestión en Ciencia, Innovación, Tecnología y Organizaciones
Algunas investigaciones relevantes del programa han sido:
- La participación de las especies menores en pequeños productores a la seguridad alimentaria en el área metropolitana de Bogotá
- Diseño y desarrollo de software de un simulador de planta de procesamiento de sub productos lácteos tipo laboratorio de práctica
- Análisis de las buenas prácticas acuícolas en el sector de peces ornamentales
- Estimación de la captura de carbono y flujo de nutrientes en un sistema silvopastoril con Acacia decurrens y pasto Pennisetum clandestinum en el municipio de Mosquera- Cundinamarca.
- Evaluación de un prototipo acuapónico experimental como modelo de seguridad agroalimentaria para población campesina y vulnerable en el municipio de Sasaima-Cundinamarca.
- Unidades Productivas Agropecuarias para la reparación de víctimas: Población vulnerable del municipio de La Peña - Cundinamarca
- Evaluación de la eficiencia productiva de peces disco (Symphysodon) en la etapa de alevinaje de la empresa mordiscos
- Evaluación de la producción de biomasa, concentración de nutrientes a diferentes alturas de corte y aceptabilidad de acacia De currens en un sistema silvopastoril intensivo.
- Estrategias pedagógicas que promuevan la Adaptación de la Agricultura Familiar y la Producción Pecuaria al Cambio Climático en el municipio de Tabio (Cundinamarca)
